Show SIM4 / tBLASTn alignment result

PARAMETERS:
Query Sequence ID: NM_007297.1
Subject Sequence ID: ENSG00000012048
Subject Sequence type: 2


seq1 = /RAID/mart2/Splice/public_html/fasta/rna.fa/NM_00/NM_007297.1, 6419 bp
seq2 = /RAID/mart2/Splice/web_temp/fasta/ENSG00000012048 (ENSG00000012048), 81091 bp

>gi|6552304|ref|NM_007297.1| Homo sapiens breast cancer 1, early onset (BRCA1), transcript variant BRCA1-delta2-10, mRNA
>ENSG00000012048

(complement)

1-122  (1-121)   95% ->
123-3548  (30532-33957)   100% ->
3549-3637  (34360-34448)   100% ->
3638-3809  (42817-42988)   100% ->
3810-3936  (48778-48904)   100% ->
3937-4127  (50871-51061)   100% ->
4128-4438  (54154-54464)   100% ->
4439-4526  (57697-57784)   100% ->
4527-4604  (61441-61518)   100% ->
4605-4645  (62019-62059)   100% ->
4646-4729  (68257-68340)   100% ->
4730-4784  (74275-74329)   100% ->
4785-4858  (76198-76271)   100% ->
4859-4919  (77689-77749)   100% ->
4920-6419  (79590-81091)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 AAAACTGCGACTGCGCGGCGTGAGCTCGCTGAGACTTCCTGGACCCCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |
      1 AAAACTGCGACTGCGCGGCGTGAGCTCGCTGAGACTTCCTGGACGGGGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCAGGCTGTGGGGTTTCTCAGATAACTGGGCCCCTGCGCTCAGGAGGCCT
        |-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     51 C AGGCTGTGGGGTTTCTCAGATAACTGGGCCCCTGCGCTCAGGAGGCCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCACCCTCTGCTCTGGGTAAAG         CTGCTTGTGAATTTTCTGA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
    100 TCACCCTCTGCTCTGGGTAAAGGTA...CAGCTGCTTGTGAATTTTCTGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GACGGATGTAACAAATACTGAACATCATCAACCCAGTAATAATGATTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  30551 GACGGATGTAACAAATACTGAACATCATCAACCCAGTAATAATGATTTGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 ACACCACTGAGAAGCGTGCAGCTGAGAGGCATCCAGAAAAGTATCAGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  30601 ACACCACTGAGAAGCGTGCAGCTGAGAGGCATCCAGAAAAGTATCAGGGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AGTTCTGTTTCAAACTTGCATGTGGAGCCATGTGGCACAAATACTCATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  30651 AGTTCTGTTTCAAACTTGCATGTGGAGCCATGTGGCACAAATACTCATGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CAGCTCATTACAGCATGAGAACAGCAGTTTATTACTCACTAAAGACAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  30701 CAGCTCATTACAGCATGAGAACAGCAGTTTATTACTCACTAAAGACAGAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 TGAATGTAGAAAAGGCTGAATTCTGTAATAAAAGCAAACAGCCTGGCTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  30751 TGAATGTAGAAAAGGCTGAATTCTGTAATAAAAGCAAACAGCCTGGCTTA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 GCAAGGAGCCAACATAACAGATGGGCTGGAAGTAAGGAAACATGTAATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  30801 GCAAGGAGCCAACATAACAGATGGGCTGGAAGTAAGGAAACATGTAATGA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 TAGGCGGACTCCCAGCACAGAAAAAAAGGTAGATCTGAATGCTGATCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  30851 TAGGCGGACTCCCAGCACAGAAAAAAAGGTAGATCTGAATGCTGATCCCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 TGTGTGAGAGAAAAGAATGGAATAAGCAGAAACTGCCATGCTCAGAGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  30901 TGTGTGAGAGAAAAGAATGGAATAAGCAGAAACTGCCATGCTCAGAGAAT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 CCTAGAGATACTGAAGATGTTCCTTGGATAACACTAAATAGCAGCATTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  30951 CCTAGAGATACTGAAGATGTTCCTTGGATAACACTAAATAGCAGCATTCA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 GAAAGTTAATGAGTGGTTTTCCAGAAGTGATGAACTGTTAGGTTCTGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  31001 GAAAGTTAATGAGTGGTTTTCCAGAAGTGATGAACTGTTAGGTTCTGATG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 ACTCACATGATGGGGAGTCTGAATCAAATGCCAAAGTAGCTGATGTATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  31051 ACTCACATGATGGGGAGTCTGAATCAAATGCCAAAGTAGCTGATGTATTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 GACGTTCTAAATGAGGTAGATGAATATTCTGGTTCTTCAGAGAAAATAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  31101 GACGTTCTAAATGAGGTAGATGAATATTCTGGTTCTTCAGAGAAAATAGA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 CTTACTGGCCAGTGATCCTCATGAGGCTTTAATATGTAAAAGTGAAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  31151 CTTACTGGCCAGTGATCCTCATGAGGCTTTAATATGTAAAAGTGAAAGAG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 TTCACTCCAAATCAGTAGAGAGTAATATTGAAGACAAAATATTTGGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  31201 TTCACTCCAAATCAGTAGAGAGTAATATTGAAGACAAAATATTTGGGAAA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 ACCTATCGGAAGAAGGCAAGCCTCCCCAACTTAAGCCATGTAACTGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  31251 ACCTATCGGAAGAAGGCAAGCCTCCCCAACTTAAGCCATGTAACTGAAAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 TCTAATTATAGGAGCATTTGTTACTGAGCCACAGATAATACAAGAGCGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  31301 TCTAATTATAGGAGCATTTGTTACTGAGCCACAGATAATACAAGAGCGTC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 CCCTCACAAATAAATTAAAGCGTAAAAGGAGACCTACATCAGGCCTTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  31351 CCCTCACAAATAAATTAAAGCGTAAAAGGAGACCTACATCAGGCCTTCAT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 CCTGAGGATTTTATCAAGAAAGCAGATTTGGCAGTTCAAAAGACTCCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  31401 CCTGAGGATTTTATCAAGAAAGCAGATTTGGCAGTTCAAAAGACTCCTGA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1042 AATGATAAATCAGGGAACTAACCAAACGGAGCAGAATGGTCAAGTGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  31451 AATGATAAATCAGGGAACTAACCAAACGGAGCAGAATGGTCAAGTGATGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1092 ATATTACTAATAGTGGTCATGAGAATAAAACAAAAGGTGATTCTATTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  31501 ATATTACTAATAGTGGTCATGAGAATAAAACAAAAGGTGATTCTATTCAG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1142 AATGAGAAAAATCCTAACCCAATAGAATCACTCGAAAAAGAATCTGCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  31551 AATGAGAAAAATCCTAACCCAATAGAATCACTCGAAAAAGAATCTGCTTT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1192 CAAAACGAAAGCTGAACCTATAAGCAGCAGTATAAGCAATATGGAACTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  31601 CAAAACGAAAGCTGAACCTATAAGCAGCAGTATAAGCAATATGGAACTCG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1242 AATTAAATATCCACAATTCAAAAGCACCTAAAAAGAATAGGCTGAGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  31651 AATTAAATATCCACAATTCAAAAGCACCTAAAAAGAATAGGCTGAGGAGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1292 AAGTCTTCTACCAGGCATATTCATGCGCTTGAACTAGTAGTCAGTAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  31701 AAGTCTTCTACCAGGCATATTCATGCGCTTGAACTAGTAGTCAGTAGAAA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1342 TCTAAGCCCACCTAATTGTACTGAATTGCAAATTGATAGTTGTTCTAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  31751 TCTAAGCCCACCTAATTGTACTGAATTGCAAATTGATAGTTGTTCTAGCA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1392 GTGAAGAGATAAAGAAAAAAAAGTACAACCAAATGCCAGTCAGGCACAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  31801 GTGAAGAGATAAAGAAAAAAAAGTACAACCAAATGCCAGTCAGGCACAGC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1442 AGAAACCTACAACTCATGGAAGGTAAAGAACCTGCAACTGGAGCCAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  31851 AGAAACCTACAACTCATGGAAGGTAAAGAACCTGCAACTGGAGCCAAGAA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1492 GAGTAACAAGCCAAATGAACAGACAAGTAAAAGACATGACAGCGATACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  31901 GAGTAACAAGCCAAATGAACAGACAAGTAAAAGACATGACAGCGATACTT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1542 TCCCAGAGCTGAAGTTAACAAATGCACCTGGTTCTTTTACTAAGTGTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  31951 TCCCAGAGCTGAAGTTAACAAATGCACCTGGTTCTTTTACTAAGTGTTCA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1592 AATACCAGTGAACTTAAAGAATTTGTCAATCCTAGCCTTCCAAGAGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  32001 AATACCAGTGAACTTAAAGAATTTGTCAATCCTAGCCTTCCAAGAGAAGA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1642 AAAAGAAGAGAAACTAGAAACAGTTAAAGTGTCTAATAATGCTGAAGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  32051 AAAAGAAGAGAAACTAGAAACAGTTAAAGTGTCTAATAATGCTGAAGACC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1692 CCAAAGATCTCATGTTAAGTGGAGAAAGGGTTTTGCAAACTGAAAGATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  32101 CCAAAGATCTCATGTTAAGTGGAGAAAGGGTTTTGCAAACTGAAAGATCT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1742 GTAGAGAGTAGCAGTATTTCATTGGTACCTGGTACTGATTATGGCACTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  32151 GTAGAGAGTAGCAGTATTTCATTGGTACCTGGTACTGATTATGGCACTCA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1792 GGAAAGTATCTCGTTACTGGAAGTTAGCACTCTAGGGAAGGCAAAAACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  32201 GGAAAGTATCTCGTTACTGGAAGTTAGCACTCTAGGGAAGGCAAAAACAG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1842 AACCAAATAAATGTGTGAGTCAGTGTGCAGCATTTGAAAACCCCAAGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  32251 AACCAAATAAATGTGTGAGTCAGTGTGCAGCATTTGAAAACCCCAAGGGA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1892 CTAATTCATGGTTGTTCCAAAGATAATAGAAATGACACAGAAGGCTTTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  32301 CTAATTCATGGTTGTTCCAAAGATAATAGAAATGACACAGAAGGCTTTAA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1942 GTATCCATTGGGACATGAAGTTAACCACAGTCGGGAAACAAGCATAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  32351 GTATCCATTGGGACATGAAGTTAACCACAGTCGGGAAACAAGCATAGAAA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1992 TGGAAGAAAGTGAACTTGATGCTCAGTATTTGCAGAATACATTCAAGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  32401 TGGAAGAAAGTGAACTTGATGCTCAGTATTTGCAGAATACATTCAAGGTT

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2042 TCAAAGCGCCAGTCATTTGCTCCGTTTTCAAATCCAGGAAATGCAGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  32451 TCAAAGCGCCAGTCATTTGCTCCGTTTTCAAATCCAGGAAATGCAGAAGA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2092 GGAATGTGCAACATTCTCTGCCCACTCTGGGTCCTTAAAGAAACAAAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  32501 GGAATGTGCAACATTCTCTGCCCACTCTGGGTCCTTAAAGAAACAAAGTC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2142 CAAAAGTCACTTTTGAATGTGAACAAAAGGAAGAAAATCAAGGAAAGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  32551 CAAAAGTCACTTTTGAATGTGAACAAAAGGAAGAAAATCAAGGAAAGAAT

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2192 GAGTCTAATATCAAGCCTGTACAGACAGTTAATATCACTGCAGGCTTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  32601 GAGTCTAATATCAAGCCTGTACAGACAGTTAATATCACTGCAGGCTTTCC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2242 TGTGGTTGGTCAGAAAGATAAGCCAGTTGATAATGCCAAATGTAGTATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  32651 TGTGGTTGGTCAGAAAGATAAGCCAGTTGATAATGCCAAATGTAGTATCA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2292 AAGGAGGCTCTAGGTTTTGTCTATCATCTCAGTTCAGAGGCAACGAAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  32701 AAGGAGGCTCTAGGTTTTGTCTATCATCTCAGTTCAGAGGCAACGAAACT

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2342 GGACTCATTACTCCAAATAAACATGGACTTTTACAAAACCCATATCGTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  32751 GGACTCATTACTCCAAATAAACATGGACTTTTACAAAACCCATATCGTAT

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2392 ACCACCACTTTTTCCCATCAAGTCATTTGTTAAAACTAAATGTAAGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  32801 ACCACCACTTTTTCCCATCAAGTCATTTGTTAAAACTAAATGTAAGAAAA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2442 ATCTGCTAGAGGAAAACTTTGAGGAACATTCAATGTCACCTGAAAGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  32851 ATCTGCTAGAGGAAAACTTTGAGGAACATTCAATGTCACCTGAAAGAGAA

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2492 ATGGGAAATGAGAACATTCCAAGTACAGTGAGCACAATTAGCCGTAATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  32901 ATGGGAAATGAGAACATTCCAAGTACAGTGAGCACAATTAGCCGTAATAA

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2542 CATTAGAGAAAATGTTTTTAAAGAAGCCAGCTCAAGCAATATTAATGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  32951 CATTAGAGAAAATGTTTTTAAAGAAGCCAGCTCAAGCAATATTAATGAAG

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2592 TAGGTTCCAGTACTAATGAAGTGGGCTCCAGTATTAATGAAATAGGTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  33001 TAGGTTCCAGTACTAATGAAGTGGGCTCCAGTATTAATGAAATAGGTTCC

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2642 AGTGATGAAAACATTCAAGCAGAACTAGGTAGAAACAGAGGGCCAAAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  33051 AGTGATGAAAACATTCAAGCAGAACTAGGTAGAAACAGAGGGCCAAAATT

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2692 GAATGCTATGCTTAGATTAGGGGTTTTGCAACCTGAGGTCTATAAACAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  33101 GAATGCTATGCTTAGATTAGGGGTTTTGCAACCTGAGGTCTATAAACAAA

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2742 GTCTTCCTGGAAGTAATTGTAAGCATCCTGAAATAAAAAAGCAAGAATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  33151 GTCTTCCTGGAAGTAATTGTAAGCATCCTGAAATAAAAAAGCAAGAATAT

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2792 GAAGAAGTAGTTCAGACTGTTAATACAGATTTCTCTCCATATCTGATTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  33201 GAAGAAGTAGTTCAGACTGTTAATACAGATTTCTCTCCATATCTGATTTC

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2842 AGATAACTTAGAACAGCCTATGGGAAGTAGTCATGCATCTCAGGTTTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  33251 AGATAACTTAGAACAGCCTATGGGAAGTAGTCATGCATCTCAGGTTTGTT

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2892 CTGAGACACCTGATGACCTGTTAGATGATGGTGAAATAAAGGAAGATACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  33301 CTGAGACACCTGATGACCTGTTAGATGATGGTGAAATAAAGGAAGATACT

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2942 AGTTTTGCTGAAAATGACATTAAGGAAAGTTCTGCTGTTTTTAGCAAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  33351 AGTTTTGCTGAAAATGACATTAAGGAAAGTTCTGCTGTTTTTAGCAAAAG

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2992 CGTCCAGAAAGGAGAGCTTAGCAGGAGTCCTAGCCCTTTCACCCATACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  33401 CGTCCAGAAAGGAGAGCTTAGCAGGAGTCCTAGCCCTTTCACCCATACAC

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3042 ATTTGGCTCAGGGTTACCGAAGAGGGGCCAAGAAATTAGAGTCCTCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  33451 ATTTGGCTCAGGGTTACCGAAGAGGGGCCAAGAAATTAGAGTCCTCAGAA

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3092 GAGAACTTATCTAGTGAGGATGAAGAGCTTCCCTGCTTCCAACACTTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  33501 GAGAACTTATCTAGTGAGGATGAAGAGCTTCCCTGCTTCCAACACTTGTT

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3142 ATTTGGTAAAGTAAACAATATACCTTCTCAGTCTACTAGGCATAGCACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  33551 ATTTGGTAAAGTAAACAATATACCTTCTCAGTCTACTAGGCATAGCACCG

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3192 TTGCTACCGAGTGTCTGTCTAAGAACACAGAGGAGAATTTATTATCATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  33601 TTGCTACCGAGTGTCTGTCTAAGAACACAGAGGAGAATTTATTATCATTG

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3242 AAGAATAGCTTAAATGACTGCAGTAACCAGGTAATATTGGCAAAGGCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  33651 AAGAATAGCTTAAATGACTGCAGTAACCAGGTAATATTGGCAAAGGCATC

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3292 TCAGGAACATCACCTTAGTGAGGAAACAAAATGTTCTGCTAGCTTGTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  33701 TCAGGAACATCACCTTAGTGAGGAAACAAAATGTTCTGCTAGCTTGTTTT

   3350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3342 CTTCACAGTGCAGTGAATTGGAAGACTTGACTGCAAATACAAACACCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  33751 CTTCACAGTGCAGTGAATTGGAAGACTTGACTGCAAATACAAACACCCAG

   3400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3392 GATCCTTTCTTGATTGGTTCTTCCAAACAAATGAGGCATCAGTCTGAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  33801 GATCCTTTCTTGATTGGTTCTTCCAAACAAATGAGGCATCAGTCTGAAAG

   3450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3442 CCAGGGAGTTGGTCTGAGTGACAAGGAATTGGTTTCAGATGATGAAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  33851 CCAGGGAGTTGGTCTGAGTGACAAGGAATTGGTTTCAGATGATGAAGAAA

   3500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3492 GAGGAACGGGCTTGGAAGAAAATAATCAAGAAGAGCAAAGCATGGATTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  33901 GAGGAACGGGCTTGGAAGAAAATAATCAAGAAGAGCAAAGCATGGATTCA

   3550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3542 AACTTAG         GTGAAGCAGCATCTGGGTGTGAGAGTGAAACAAG
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
  33951 AACTTAGGTA...AAGGTGAAGCAGCATCTGGGTGTGAGAGTGAAACAAG

   3600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3583 CGTCTCTGAAGACTGCTCAGGGCTATCCTCTCAGAGTGACATTTTAACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  34394 CGTCTCTGAAGACTGCTCAGGGCTATCCTCTCAGAGTGACATTTTAACCA

   3650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3633 CTCAG         CAGAGGGATACCATGCAACATAACCTGATAAAGCTC
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  34444 CTCAGGTA...AAGCAGAGGGATACCATGCAACATAACCTGATAAAGCTC

   3700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3674 CAGCAGGAAATGGCTGAACTAGAAGCTGTGTTAGAACAGCATGGGAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  42853 CAGCAGGAAATGGCTGAACTAGAAGCTGTGTTAGAACAGCATGGGAGCCA

   3750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3724 GCCTTCTAACAGCTACCCTTCCATCATAAGTGACTCTTCTGCCCTTGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  42903 GCCTTCTAACAGCTACCCTTCCATCATAAGTGACTCTTCTGCCCTTGAGG

   3800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3774 ACCTGCGAAATCCAGAACAAAGCACATCAGAAAAAG         CAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
  42953 ACCTGCGAAATCCAGAACAAAGCACATCAGAAAAAGGTG...AAGCAGTA

   3850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3815 TTAACTTCACAGAAAAGTAGTGAATACCCTATAAGCCAGAATCCAGAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  48783 TTAACTTCACAGAAAAGTAGTGAATACCCTATAAGCCAGAATCCAGAAGG

   3900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3865 CCTTTCTGCTGACAAGTTTGAGGTGTCTGCAGATAGTTCTACCAGTAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  48833 CCTTTCTGCTGACAAGTTTGAGGTGTCTGCAGATAGTTCTACCAGTAAAA

   3950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3915 ATAAAGAACCAGGAGTGGAAAG         GTCATCCCCTTCTAAATGC
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
  48883 ATAAAGAACCAGGAGTGGAAAGGTA...TAGGTCATCCCCTTCTAAATGC

   4000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3956 CCATCATTAGATGATAGGTGGTACATGCACAGTTGCTCTGGGAGTCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  50890 CCATCATTAGATGATAGGTGGTACATGCACAGTTGCTCTGGGAGTCTTCA

   4050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   4006 GAATAGAAACTACCCATCTCAAGAGGAGCTCATTAAGGTTGTTGATGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  50940 GAATAGAAACTACCCATCTCAAGAGGAGCTCATTAAGGTTGTTGATGTGG

   4100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   4056 AGGAGCAACAGCTGGAAGAGTCTGGGCCACACGATTTGACGGAAACATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  50990 AGGAGCAACAGCTGGAAGAGTCTGGGCCACACGATTTGACGGAAACATCT

   4150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   4106 TACTTGCCAAGGCAAGATCTAG         AGGGAACCCCTTACCTGGA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
  51040 TACTTGCCAAGGCAAGATCTAGGTA...CAGAGGGAACCCCTTACCTGGA

   4200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   4147 ATCTGGAATCAGCCTCTTCTCTGATGACCCTGAATCTGATCCTTCTGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  54173 ATCTGGAATCAGCCTCTTCTCTGATGACCCTGAATCTGATCCTTCTGAAG

   4250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   4197 ACAGAGCCCCAGAGTCAGCTCGTGTTGGCAACATACCATCTTCAACCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  54223 ACAGAGCCCCAGAGTCAGCTCGTGTTGGCAACATACCATCTTCAACCTCT

   4300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   4247 GCATTGAAAGTTCCCCAATTGAAAGTTGCAGAATCTGCCCAGAGTCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  54273 GCATTGAAAGTTCCCCAATTGAAAGTTGCAGAATCTGCCCAGAGTCCAGC

   4350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   4297 TGCTGCTCATACTACTGATACTGCTGGGTATAATGCAATGGAAGAAAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  54323 TGCTGCTCATACTACTGATACTGCTGGGTATAATGCAATGGAAGAAAGTG

   4400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   4347 TGAGCAGGGAGAAGCCAGAATTGACAGCTTCAACAGAAAGGGTCAACAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  54373 TGAGCAGGGAGAAGCCAGAATTGACAGCTTCAACAGAAAGGGTCAACAAA

   4450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   4397 AGAATGTCCATGGTGGTGTCTGGCCTGACCCCAGAAGAATTT        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
  54423 AGAATGTCCATGGTGGTGTCTGGCCTGACCCCAGAAGAATTTGTG...CA

   4500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   4439  ATGCTCGTGTACAAGTTTGCCAGAAAACACCACATCACTTTAACTAATC
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  57696 GATGCTCGTGTACAAGTTTGCCAGAAAACACCACATCACTTTAACTAATC

   4550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   4488 TAATTACTGAAGAGACTACTCATGTTGTTATGAAAACAG         AT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
  57746 TAATTACTGAAGAGACTACTCATGTTGTTATGAAAACAGGTA...CAGAT

   4600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   4529 GCTGAGTTTGTGTGTGAACGGACACTGAAATATTTTCTAGGAATTGCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  61443 GCTGAGTTTGTGTGTGAACGGACACTGAAATATTTTCTAGGAATTGCGGG

   4650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   4579 AGGAAAATGGGTAGTTAGCTATTTCT         GGGTGACCCAGTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
  61493 AGGAAAATGGGTAGTTAGCTATTTCTGTA...TAGGGGTGACCCAGTCTA

   4700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   4620 TTAAAGAAAGAAAAATGCTGAATGAG         CATGATTTTGAAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
  62034 TTAAAGAAAGAAAAATGCTGAATGAGGTA...CAGCATGATTTTGAAGTC

   4750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   4661 AGAGGAGATGTGGTCAATGGAAGAAACCACCAAGGTCCAAAGCGAGCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  68272 AGAGGAGATGTGGTCAATGGAAGAAACCACCAAGGTCCAAAGCGAGCAAG

   4800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   4711 AGAATCCCAGGACAGAAAG         ATCTTCAGGGGGCTAGAAATCT
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
  68322 AGAATCCCAGGACAGAAAGGTA...CAGATCTTCAGGGGGCTAGAAATCT

   4850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   4752 GTTGCTATGGGCCCTTCACCAACATGCCCACAG         ATCAACTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
  74297 GTTGCTATGGGCCCTTCACCAACATGCCCACAGGTA...TAGATCAACTG

   4900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   4793 GAATGGATGGTACAGCTGTGTGGTGCTTCTGTGGTGAAGGAGCTTTCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  76206 GAATGGATGGTACAGCTGTGTGGTGCTTCTGTGGTGAAGGAGCTTTCATC

   4950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   4843 ATTCACCCTTGGCACA         GGTGTCCACCCAATTGTGGTTGTGC
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
  76256 ATTCACCCTTGGCACAGTA...CAGGGTGTCCACCCAATTGTGGTTGTGC

   5000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   4884 AGCCAGATGCCTGGACAGAGGACAATGGCTTCCATG         CAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
  77714 AGCCAGATGCCTGGACAGAGGACAATGGCTTCCATGGTA...CAGCAATT

   5050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   4925 GGGCAGATGTGTGAGGCACCTGTGGTGACCCGAGAGTGGGTGTTGGACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  79595 GGGCAGATGTGTGAGGCACCTGTGGTGACCCGAGAGTGGGTGTTGGACAG

   5100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   4975 TGTAGCACTCTACCAGTGCCAGGAGCTGGACACCTACCTGATACCCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  79645 TGTAGCACTCTACCAGTGCCAGGAGCTGGACACCTACCTGATACCCCAGA

   5150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   5025 TCCCCCACAGCCACTACTGACTGCAGCCAGCCACAGGTACAGAGC ACAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||
  79695 TCCCCCACAGCCACTACTGACTGCAGCCAGCCACAGGTACAGAGCCACAG

   5200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   5074 GACCCCAAGAATGAGCTTACAAAGTGGCCTTTCCAGGCCCTGGGAGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  79745 GACCCCAAGAATGAGCTTACAAAGTGGCCTTTCCAGGCCCTGGGAGCTCC

   5250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   5124 TCTCACTCTTCAGTCCTTCTACTGTCCTGGCTACTAAATATTTTATGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  79795 TCTCACTCTTCAGTCCTTCTACTGTCCTGGCTACTAAATATTTTATGTAC

   5300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   5174 ATCAGCCTGAAAAGGACTTCTGGCTATGCAAGGGTCCCTTAAAGATTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  79845 ATCAGCCTGAAAAGGACTTCTGGCTATGCAAGGGTCCCTTAAAGATTTTC

   5350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   5224 TGCTTGAAGTCTCCCTTGGAAATCTGCCATGAGCACAAAATTATGGTAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  79895 TGCTTGAAGTCTCCCTTGGAAATCTGCCATGAGCACAAAATTATGGTAAT

   5400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   5274 TTTTCACCTGAGAAGATTTTAAAACCATTTAAACGCCACCAATTGAGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  79945 TTTTCACCTGAGAAGATTTTAAAACCATTTAAACGCCACCAATTGAGCAA

   5450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   5324 GATGCTGATTCATTATTTATCAGCCCTATTCTTTCTATTCAGGCTGTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  79995 GATGCTGATTCATTATTTATCAGCCCTATTCTTTCTATTCAGGCTGTTGT

   5500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   5374 TGGCTTAGGGCTGGAAGCACAGAGTGGCTTGGCCTCAAGAGAATAGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  80045 TGGCTTAGGGCTGGAAGCACAGAGTGGCTTGGCCTCAAGAGAATAGCTGG

   5550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   5424 TTTCCCTAAGTTTACTTCTCTAAAACCCTGTGTTCACAAAGGCAGAGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  80095 TTTCCCTAAGTTTACTTCTCTAAAACCCTGTGTTCACAAAGGCAGAGAGT

   5600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   5474 CAGACCCTTCAATGGAAGGAGAGTGCTTGGGATCGATTATGTGACTTAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  80145 CAGACCCTTCAATGGAAGGAGAGTGCTTGGGATCGATTATGTGACTTAAA

   5650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   5524 GTCAGAATAGTCCTTGGGCAGTTCTCAAATGTTGGAGTGGAACATTGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  80195 GTCAGAATAGTCCTTGGGCAGTTCTCAAATGTTGGAGTGGAACATTGGGG

   5700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   5574 AGGAAATTCTGAGGCAGGTATTAGAAATGAAAAGGAAACTTGAAACCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  80245 AGGAAATTCTGAGGCAGGTATTAGAAATGAAAAGGAAACTTGAAACCTGG

   5750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   5624 GCATGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  80295 GCATGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGG

   5800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   5674 CAGATCACTGGAGGTCAGGAGTTCGAAACCAGCCTGGCCAACATGGTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  80345 CAGATCACTGGAGGTCAGGAGTTCGAAACCAGCCTGGCCAACATGGTGAA

   5850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   5724 ACCCCATCTCTACTAAAAATACAGAAATTAGCCGGTCATGGTGGTGGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  80395 ACCCCATCTCTACTAAAAATACAGAAATTAGCCGGTCATGGTGGTGGACA

   5900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   5774 CCTGTAATCCCAGCTACTCAGGTGGCTAAGGCAGGAGAATCACTTCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  80445 CCTGTAATCCCAGCTACTCAGGTGGCTAAGGCAGGAGAATCACTTCAGCC

   5950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   5824 CGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATCATACCACGGCACTCCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  80495 CGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATCATACCACGGCACTCCAGCC

   6000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   5874 TGGGTGACAGTGAGACTGTGGCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAA GGAAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||||||
  80545 TGGGTGACAGTGAGACTGTGGCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGAAAAT

   6050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   5923 GAAACTAGGAAAGGTTTCTTAAAGTCTGAGATATATTTGCTAGATTTCTA
        |||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
  80595 GAAACTAGAAGAGATTTCTAAAAGTCTGAGATATATTTGCTAGATTTCTA

   6100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   5973 AAGAATGTGTTCTAAAACAGCAGAAGATTTTCAAGAACCGGTTTCCAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  80645 AAGAATGTGTTCTAAAACAGCAGAAGATTTTCAAGAACCGGTTTCCAAAG

   6150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   6023 ACAGTCTTCTAATTCCTCATTAGTAATAAGTAAAATGTTTATTGTTGTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  80695 ACAGTCTTCTAATTCCTCATTAGTAATAAGTAAAATGTTTATTGTTGTAG

   6200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   6073 CTCTGGTATATAATCCATTCCTCTTAAAATATAAGACCTCTGGCATGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  80745 CTCTGGTATATAATCCATTCCTCTTAAAATATAAGACCTCTGGCATGAAT

   6250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   6123 ATTTCATATCTATAAAATGACAGATCCCACCAGGAAGGAAGCTGTTGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  80795 ATTTCATATCTATAAAATGACAGATCCCACCAGGAAGGAAGCTGTTGCTT

   6300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   6173 TCTTTGAGGTGATTTTTTTCCTTTGCTCCCTGTTGCTGAAACCATACAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  80845 TCTTTGAGGTGATTTTTTTCCTTTGCTCCCTGTTGCTGAAACCATACAGC

   6350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   6223 TTCATAAATAATTTTGCTTGCTGAAGGAAGAAAAAGTGTTTTTCATAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  80895 TTCATAAATAATTTTGCTTGCTGAAGGAAGAAAAAGTGTTTTTCATAAAC

   6400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   6273 CCATTATCCAGGACTGTTTATAGCTGTTGGAAGGACTAGGTCTTCCCTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  80945 CCATTATCCAGGACTGTTTATAGCTGTTGGAAGGACTAGGTCTTCCCTAG

   6450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   6323 CCCCCCCAGTGTGCAAGGGCAGTGAAGACTTGATTGTACAAAATACGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  80995 CCCCCCCAGTGTGCAAGGGCAGTGAAGACTTGATTGTACAAAATACGTTT

   6500     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   6373 TGTAAATGTTGTGCTGTTAACACTGCAAATAAACTTGGTAGCAAACA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  81045 TGTAAATGTTGTGCTGTTAACACTGCAAATAAACTTGGTAGCAAACA

END