Show SIM4 / tBLASTn alignment result

PARAMETERS:
Query Sequence ID: NM_007300.1
Subject Sequence ID: ENSG00000012048
Subject Sequence type: 2


seq1 = /RAID/mart2/Splice/public_html/fasta/rna.fa/NM_00/NM_007300.1, 6313 bp
seq2 = /RAID/mart2/Splice/web_temp/fasta/ENSG00000012048 (ENSG00000012048), 81091 bp

>gi|6552310|ref|NM_007300.1| Homo sapiens breast cancer 1, early onset (BRCA1), transcript variant BRCA1-delta14-18, mRNA
>ENSG00000012048

(complement)

1-122  (1-121)   95% ->
123-221  (1277-1375)   100% ->
222-275  (9613-9666)   100% ->
276-353  (18859-18936)   100% ->
354-442  (20436-20524)   100% ->
443-582  (21131-21270)   100% ->
583-688  (25512-25617)   100% ->
689-734  (28103-28148)   100% ->
735-811  (29470-29546)   100% ->
812-4237  (30532-33957)   100% ->
4238-4326  (34360-34448)   100% ->
4327-4498  (42817-42988)   100% ->
4499-4539  (62019-62059)   100% ->
4540-4623  (68257-68340)   100% ->
4624-4678  (74275-74329)   100% ->
4679-4752  (76198-76271)   100% ->
4753-4813  (77689-77749)   100% ->
4814-6313  (79590-81091)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 AAAACTGCGACTGCGCGGCGTGAGCTCGCTGAGACTTCCTGGACCCCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |
      1 AAAACTGCGACTGCGCGGCGTGAGCTCGCTGAGACTTCCTGGACGGGGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCAGGCTGTGGGGTTTCTCAGATAACTGGGCCCCTGCGCTCAGGAGGCCT
        |-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     51 C AGGCTGTGGGGTTTCTCAGATAACTGGGCCCCTGCGCTCAGGAGGCCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCACCCTCTGCTCTGGGTAAAG         TTCATTGGAACAGAAAGAA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
    100 TCACCCTCTGCTCTGGGTAAAGGTA...AAGTTCATTGGAACAGAAAGAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ATGGATTTATCTGCTCTTCGCGTTGAAGAAGTACAAAATGTCATTAATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   1296 ATGGATTTATCTGCTCTTCGCGTTGAAGAAGTACAAAATGTCATTAATGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TATGCAGAAAATCTTAGAGTGTCCCATCTG         TCTGGAGTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
   1346 TATGCAGAAAATCTTAGAGTGTCCCATCTGGTA...TAGTCTGGAGTTGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TCAAGGAACCTGTCTCCACAAAGTGTGACCACATATTTTGCAA       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
   9624 TCAAGGAACCTGTCTCCACAAAGTGTGACCACATATTTTGCAAGTA...T

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    276   ATTTTGCATGCTGAAACTTCTCAACCAGAAGAAAGGGCCTTCACAGTG
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  18857 AGATTTTGCATGCTGAAACTTCTCAACCAGAAGAAAGGGCCTTCACAGTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 TCCTTTATGTAAGAATGATATAACCAAAAG         GAGCCTACAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
  18907 TCCTTTATGTAAGAATGATATAACCAAAAGGTA...CAGGAGCCTACAAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 AAAGTACGAGATTTAGTCAACTTGTTGAAGAGCTATTGAAAATCATTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  20447 AAAGTACGAGATTTAGTCAACTTGTTGAAGAGCTATTGAAAATCATTTGT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 GCTTTTCAGCTTGACACAGGTTTGGAGT         ATGCAAACAGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
  20497 GCTTTTCAGCTTGACACAGGTTTGGAGTGTA...CAGATGCAAACAGCTA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 TAATTTTGCAAAAAAGGAAAATAACTCTCCTGAACATCTAAAAGATGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  21144 TAATTTTGCAAAAAAGGAAAATAACTCTCCTGAACATCTAAAAGATGAAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 TTTCTATCATCCAAAGTATGGGCTACAGAAACCGTGCCAAAAGACTTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  21194 TTTCTATCATCCAAAGTATGGGCTACAGAAACCGTGCCAAAAGACTTCTA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 CAGAGTGAACCCGAAAATCCTTCCTTG         CAGGAAACCAGTCT
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
  21244 CAGAGTGAACCCGAAAATCCTTCCTTGGTA...TAGCAGGAAACCAGTCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 CAGTGTCCAACTCTCTAACCTTGGAACTGTGAGAACTCTGAGGACAAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  25526 CAGTGTCCAACTCTCTAACCTTGGAACTGTGAGAACTCTGAGGACAAAGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 AGCGGATACAACCTCAAAAGACGTCTGTCTACATTGAATTGG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
  25576 AGCGGATACAACCTCAAAAGACGTCTGTCTACATTGAATTGGGTA...TA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    689  GATCTGATTCTTCTGAAGATACCGTTAATAAGGCAACTTATTGCAG   
        >||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
  28102 GGATCTGATTCTTCTGAAGATACCGTTAATAAGGCAACTTATTGCAGGTG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    735       TGTGGGAGATCAAGAATTGTTACAAATCACCCCTCAAGGAACCA
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  28152 ...TAGTGTGGGAGATCAAGAATTGTTACAAATCACCCCTCAAGGAACCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    779 GGGATGAAATCAGTTTGGATTCTGCAAAAAAGG         CTGCTTGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
  29514 GGGATGAAATCAGTTTGGATTCTGCAAAAAAGGGTA...CAGCTGCTTGT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    820 GAATTTTCTGAGACGGATGTAACAAATACTGAACATCATCAACCCAGTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  30540 GAATTTTCTGAGACGGATGTAACAAATACTGAACATCATCAACCCAGTAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    870 TAATGATTTGAACACCACTGAGAAGCGTGCAGCTGAGAGGCATCCAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  30590 TAATGATTTGAACACCACTGAGAAGCGTGCAGCTGAGAGGCATCCAGAAA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    920 AGTATCAGGGTAGTTCTGTTTCAAACTTGCATGTGGAGCCATGTGGCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  30640 AGTATCAGGGTAGTTCTGTTTCAAACTTGCATGTGGAGCCATGTGGCACA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 AATACTCATGCCAGCTCATTACAGCATGAGAACAGCAGTTTATTACTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  30690 AATACTCATGCCAGCTCATTACAGCATGAGAACAGCAGTTTATTACTCAC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 TAAAGACAGAATGAATGTAGAAAAGGCTGAATTCTGTAATAAAAGCAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  30740 TAAAGACAGAATGAATGTAGAAAAGGCTGAATTCTGTAATAAAAGCAAAC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 AGCCTGGCTTAGCAAGGAGCCAACATAACAGATGGGCTGGAAGTAAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  30790 AGCCTGGCTTAGCAAGGAGCCAACATAACAGATGGGCTGGAAGTAAGGAA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 ACATGTAATGATAGGCGGACTCCCAGCACAGAAAAAAAGGTAGATCTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  30840 ACATGTAATGATAGGCGGACTCCCAGCACAGAAAAAAAGGTAGATCTGAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 TGCTGATCCCCTGTGTGAGAGAAAAGAATGGAATAAGCAGAAACTGCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  30890 TGCTGATCCCCTGTGTGAGAGAAAAGAATGGAATAAGCAGAAACTGCCAT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 GCTCAGAGAATCCTAGAGATACTGAAGATGTTCCTTGGATAACACTAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  30940 GCTCAGAGAATCCTAGAGATACTGAAGATGTTCCTTGGATAACACTAAAT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 AGCAGCATTCAGAAAGTTAATGAGTGGTTTTCCAGAAGTGATGAACTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  30990 AGCAGCATTCAGAAAGTTAATGAGTGGTTTTCCAGAAGTGATGAACTGTT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 AGGTTCTGATGACTCACATGATGGGGAGTCTGAATCAAATGCCAAAGTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  31040 AGGTTCTGATGACTCACATGATGGGGAGTCTGAATCAAATGCCAAAGTAG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1370 CTGATGTATTGGACGTTCTAAATGAGGTAGATGAATATTCTGGTTCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  31090 CTGATGTATTGGACGTTCTAAATGAGGTAGATGAATATTCTGGTTCTTCA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1420 GAGAAAATAGACTTACTGGCCAGTGATCCTCATGAGGCTTTAATATGTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  31140 GAGAAAATAGACTTACTGGCCAGTGATCCTCATGAGGCTTTAATATGTAA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1470 AAGTGAAAGAGTTCACTCCAAATCAGTAGAGAGTAATATTGAAGACAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  31190 AAGTGAAAGAGTTCACTCCAAATCAGTAGAGAGTAATATTGAAGACAAAA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1520 TATTTGGGAAAACCTATCGGAAGAAGGCAAGCCTCCCCAACTTAAGCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  31240 TATTTGGGAAAACCTATCGGAAGAAGGCAAGCCTCCCCAACTTAAGCCAT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1570 GTAACTGAAAATCTAATTATAGGAGCATTTGTTACTGAGCCACAGATAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  31290 GTAACTGAAAATCTAATTATAGGAGCATTTGTTACTGAGCCACAGATAAT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1620 ACAAGAGCGTCCCCTCACAAATAAATTAAAGCGTAAAAGGAGACCTACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  31340 ACAAGAGCGTCCCCTCACAAATAAATTAAAGCGTAAAAGGAGACCTACAT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1670 CAGGCCTTCATCCTGAGGATTTTATCAAGAAAGCAGATTTGGCAGTTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  31390 CAGGCCTTCATCCTGAGGATTTTATCAAGAAAGCAGATTTGGCAGTTCAA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1720 AAGACTCCTGAAATGATAAATCAGGGAACTAACCAAACGGAGCAGAATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  31440 AAGACTCCTGAAATGATAAATCAGGGAACTAACCAAACGGAGCAGAATGG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1770 TCAAGTGATGAATATTACTAATAGTGGTCATGAGAATAAAACAAAAGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  31490 TCAAGTGATGAATATTACTAATAGTGGTCATGAGAATAAAACAAAAGGTG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1820 ATTCTATTCAGAATGAGAAAAATCCTAACCCAATAGAATCACTCGAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  31540 ATTCTATTCAGAATGAGAAAAATCCTAACCCAATAGAATCACTCGAAAAA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1870 GAATCTGCTTTCAAAACGAAAGCTGAACCTATAAGCAGCAGTATAAGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  31590 GAATCTGCTTTCAAAACGAAAGCTGAACCTATAAGCAGCAGTATAAGCAA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1920 TATGGAACTCGAATTAAATATCCACAATTCAAAAGCACCTAAAAAGAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  31640 TATGGAACTCGAATTAAATATCCACAATTCAAAAGCACCTAAAAAGAATA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1970 GGCTGAGGAGGAAGTCTTCTACCAGGCATATTCATGCGCTTGAACTAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  31690 GGCTGAGGAGGAAGTCTTCTACCAGGCATATTCATGCGCTTGAACTAGTA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2020 GTCAGTAGAAATCTAAGCCCACCTAATTGTACTGAATTGCAAATTGATAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  31740 GTCAGTAGAAATCTAAGCCCACCTAATTGTACTGAATTGCAAATTGATAG

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2070 TTGTTCTAGCAGTGAAGAGATAAAGAAAAAAAAGTACAACCAAATGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  31790 TTGTTCTAGCAGTGAAGAGATAAAGAAAAAAAAGTACAACCAAATGCCAG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2120 TCAGGCACAGCAGAAACCTACAACTCATGGAAGGTAAAGAACCTGCAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  31840 TCAGGCACAGCAGAAACCTACAACTCATGGAAGGTAAAGAACCTGCAACT

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2170 GGAGCCAAGAAGAGTAACAAGCCAAATGAACAGACAAGTAAAAGACATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  31890 GGAGCCAAGAAGAGTAACAAGCCAAATGAACAGACAAGTAAAAGACATGA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2220 CAGCGATACTTTCCCAGAGCTGAAGTTAACAAATGCACCTGGTTCTTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  31940 CAGCGATACTTTCCCAGAGCTGAAGTTAACAAATGCACCTGGTTCTTTTA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2270 CTAAGTGTTCAAATACCAGTGAACTTAAAGAATTTGTCAATCCTAGCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  31990 CTAAGTGTTCAAATACCAGTGAACTTAAAGAATTTGTCAATCCTAGCCTT

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2320 CCAAGAGAAGAAAAAGAAGAGAAACTAGAAACAGTTAAAGTGTCTAATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  32040 CCAAGAGAAGAAAAAGAAGAGAAACTAGAAACAGTTAAAGTGTCTAATAA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2370 TGCTGAAGACCCCAAAGATCTCATGTTAAGTGGAGAAAGGGTTTTGCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  32090 TGCTGAAGACCCCAAAGATCTCATGTTAAGTGGAGAAAGGGTTTTGCAAA

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2420 CTGAAAGATCTGTAGAGAGTAGCAGTATTTCATTGGTACCTGGTACTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  32140 CTGAAAGATCTGTAGAGAGTAGCAGTATTTCATTGGTACCTGGTACTGAT

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2470 TATGGCACTCAGGAAAGTATCTCGTTACTGGAAGTTAGCACTCTAGGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  32190 TATGGCACTCAGGAAAGTATCTCGTTACTGGAAGTTAGCACTCTAGGGAA

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2520 GGCAAAAACAGAACCAAATAAATGTGTGAGTCAGTGTGCAGCATTTGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  32240 GGCAAAAACAGAACCAAATAAATGTGTGAGTCAGTGTGCAGCATTTGAAA

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2570 ACCCCAAGGGACTAATTCATGGTTGTTCCAAAGATAATAGAAATGACACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  32290 ACCCCAAGGGACTAATTCATGGTTGTTCCAAAGATAATAGAAATGACACA

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2620 GAAGGCTTTAAGTATCCATTGGGACATGAAGTTAACCACAGTCGGGAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  32340 GAAGGCTTTAAGTATCCATTGGGACATGAAGTTAACCACAGTCGGGAAAC

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2670 AAGCATAGAAATGGAAGAAAGTGAACTTGATGCTCAGTATTTGCAGAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  32390 AAGCATAGAAATGGAAGAAAGTGAACTTGATGCTCAGTATTTGCAGAATA

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2720 CATTCAAGGTTTCAAAGCGCCAGTCATTTGCTCCGTTTTCAAATCCAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  32440 CATTCAAGGTTTCAAAGCGCCAGTCATTTGCTCCGTTTTCAAATCCAGGA

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2770 AATGCAGAAGAGGAATGTGCAACATTCTCTGCCCACTCTGGGTCCTTAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  32490 AATGCAGAAGAGGAATGTGCAACATTCTCTGCCCACTCTGGGTCCTTAAA

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2820 GAAACAAAGTCCAAAAGTCACTTTTGAATGTGAACAAAAGGAAGAAAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  32540 GAAACAAAGTCCAAAAGTCACTTTTGAATGTGAACAAAAGGAAGAAAATC

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2870 AAGGAAAGAATGAGTCTAATATCAAGCCTGTACAGACAGTTAATATCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  32590 AAGGAAAGAATGAGTCTAATATCAAGCCTGTACAGACAGTTAATATCACT

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2920 GCAGGCTTTCCTGTGGTTGGTCAGAAAGATAAGCCAGTTGATAATGCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  32640 GCAGGCTTTCCTGTGGTTGGTCAGAAAGATAAGCCAGTTGATAATGCCAA

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2970 ATGTAGTATCAAAGGAGGCTCTAGGTTTTGTCTATCATCTCAGTTCAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  32690 ATGTAGTATCAAAGGAGGCTCTAGGTTTTGTCTATCATCTCAGTTCAGAG

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3020 GCAACGAAACTGGACTCATTACTCCAAATAAACATGGACTTTTACAAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  32740 GCAACGAAACTGGACTCATTACTCCAAATAAACATGGACTTTTACAAAAC

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3070 CCATATCGTATACCACCACTTTTTCCCATCAAGTCATTTGTTAAAACTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  32790 CCATATCGTATACCACCACTTTTTCCCATCAAGTCATTTGTTAAAACTAA

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3120 ATGTAAGAAAAATCTGCTAGAGGAAAACTTTGAGGAACATTCAATGTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  32840 ATGTAAGAAAAATCTGCTAGAGGAAAACTTTGAGGAACATTCAATGTCAC

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3170 CTGAAAGAGAAATGGGAAATGAGAACATTCCAAGTACAGTGAGCACAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  32890 CTGAAAGAGAAATGGGAAATGAGAACATTCCAAGTACAGTGAGCACAATT

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3220 AGCCGTAATAACATTAGAGAAAATGTTTTTAAAGAAGCCAGCTCAAGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  32940 AGCCGTAATAACATTAGAGAAAATGTTTTTAAAGAAGCCAGCTCAAGCAA

   3350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3270 TATTAATGAAGTAGGTTCCAGTACTAATGAAGTGGGCTCCAGTATTAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  32990 TATTAATGAAGTAGGTTCCAGTACTAATGAAGTGGGCTCCAGTATTAATG

   3400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3320 AAATAGGTTCCAGTGATGAAAACATTCAAGCAGAACTAGGTAGAAACAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  33040 AAATAGGTTCCAGTGATGAAAACATTCAAGCAGAACTAGGTAGAAACAGA

   3450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3370 GGGCCAAAATTGAATGCTATGCTTAGATTAGGGGTTTTGCAACCTGAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  33090 GGGCCAAAATTGAATGCTATGCTTAGATTAGGGGTTTTGCAACCTGAGGT

   3500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3420 CTATAAACAAAGTCTTCCTGGAAGTAATTGTAAGCATCCTGAAATAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  33140 CTATAAACAAAGTCTTCCTGGAAGTAATTGTAAGCATCCTGAAATAAAAA

   3550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3470 AGCAAGAATATGAAGAAGTAGTTCAGACTGTTAATACAGATTTCTCTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  33190 AGCAAGAATATGAAGAAGTAGTTCAGACTGTTAATACAGATTTCTCTCCA

   3600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3520 TATCTGATTTCAGATAACTTAGAACAGCCTATGGGAAGTAGTCATGCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  33240 TATCTGATTTCAGATAACTTAGAACAGCCTATGGGAAGTAGTCATGCATC

   3650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3570 TCAGGTTTGTTCTGAGACACCTGATGACCTGTTAGATGATGGTGAAATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  33290 TCAGGTTTGTTCTGAGACACCTGATGACCTGTTAGATGATGGTGAAATAA

   3700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3620 AGGAAGATACTAGTTTTGCTGAAAATGACATTAAGGAAAGTTCTGCTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  33340 AGGAAGATACTAGTTTTGCTGAAAATGACATTAAGGAAAGTTCTGCTGTT

   3750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3670 TTTAGCAAAAGCGTCCAGAAAGGAGAGCTTAGCAGGAGTCCTAGCCCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  33390 TTTAGCAAAAGCGTCCAGAAAGGAGAGCTTAGCAGGAGTCCTAGCCCTTT

   3800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3720 CACCCATACACATTTGGCTCAGGGTTACCGAAGAGGGGCCAAGAAATTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  33440 CACCCATACACATTTGGCTCAGGGTTACCGAAGAGGGGCCAAGAAATTAG

   3850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3770 AGTCCTCAGAAGAGAACTTATCTAGTGAGGATGAAGAGCTTCCCTGCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  33490 AGTCCTCAGAAGAGAACTTATCTAGTGAGGATGAAGAGCTTCCCTGCTTC

   3900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3820 CAACACTTGTTATTTGGTAAAGTAAACAATATACCTTCTCAGTCTACTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  33540 CAACACTTGTTATTTGGTAAAGTAAACAATATACCTTCTCAGTCTACTAG

   3950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3870 GCATAGCACCGTTGCTACCGAGTGTCTGTCTAAGAACACAGAGGAGAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  33590 GCATAGCACCGTTGCTACCGAGTGTCTGTCTAAGAACACAGAGGAGAATT

   4000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3920 TATTATCATTGAAGAATAGCTTAAATGACTGCAGTAACCAGGTAATATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  33640 TATTATCATTGAAGAATAGCTTAAATGACTGCAGTAACCAGGTAATATTG

   4050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3970 GCAAAGGCATCTCAGGAACATCACCTTAGTGAGGAAACAAAATGTTCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  33690 GCAAAGGCATCTCAGGAACATCACCTTAGTGAGGAAACAAAATGTTCTGC

   4100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   4020 TAGCTTGTTTTCTTCACAGTGCAGTGAATTGGAAGACTTGACTGCAAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  33740 TAGCTTGTTTTCTTCACAGTGCAGTGAATTGGAAGACTTGACTGCAAATA

   4150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   4070 CAAACACCCAGGATCCTTTCTTGATTGGTTCTTCCAAACAAATGAGGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  33790 CAAACACCCAGGATCCTTTCTTGATTGGTTCTTCCAAACAAATGAGGCAT

   4200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   4120 CAGTCTGAAAGCCAGGGAGTTGGTCTGAGTGACAAGGAATTGGTTTCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  33840 CAGTCTGAAAGCCAGGGAGTTGGTCTGAGTGACAAGGAATTGGTTTCAGA

   4250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   4170 TGATGAAGAAAGAGGAACGGGCTTGGAAGAAAATAATCAAGAAGAGCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  33890 TGATGAAGAAAGAGGAACGGGCTTGGAAGAAAATAATCAAGAAGAGCAAA

   4300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   4220 GCATGGATTCAAACTTAG         GTGAAGCAGCATCTGGGTGTGAG
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
  33940 GCATGGATTCAAACTTAGGTA...AAGGTGAAGCAGCATCTGGGTGTGAG

   4350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   4261 AGTGAAACAAGCGTCTCTGAAGACTGCTCAGGGCTATCCTCTCAGAGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  34383 AGTGAAACAAGCGTCTCTGAAGACTGCTCAGGGCTATCCTCTCAGAGTGA

   4400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   4311 CATTTTAACCACTCAG         CAGAGGGATACCATGCAACATAACC
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
  34433 CATTTTAACCACTCAGGTA...AAGCAGAGGGATACCATGCAACATAACC

   4450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   4352 TGATAAAGCTCCAGCAGGAAATGGCTGAACTAGAAGCTGTGTTAGAACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  42842 TGATAAAGCTCCAGCAGGAAATGGCTGAACTAGAAGCTGTGTTAGAACAG

   4500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   4402 CATGGGAGCCAGCCTTCTAACAGCTACCCTTCCATCATAAGTGACTCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  42892 CATGGGAGCCAGCCTTCTAACAGCTACCCTTCCATCATAAGTGACTCTTC

   4550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   4452 TGCCCTTGAGGACCTGCGAAATCCAGAACAAAGCACATCAGAAAAAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
  42942 TGCCCTTGAGGACCTGCGAAATCCAGAACAAAGCACATCAGAAAAAGGTG

   4600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   4499       GGGTGACCCAGTCTATTAAAGAAAGAAAAATGCTGAATGAG   
        ...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
  42992 ...TAGGGGTGACCCAGTCTATTAAAGAAAGAAAAATGCTGAATGAGGTA

   4650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   4540       CATGATTTTGAAGTCAGAGGAGATGTGGTCAATGGAAGAAACCA
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  62063 ...CAGCATGATTTTGAAGTCAGAGGAGATGTGGTCAATGGAAGAAACCA

   4700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   4584 CCAAGGTCCAAAGCGAGCAAGAGAATCCCAGGACAGAAAG         A
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
  68301 CCAAGGTCCAAAGCGAGCAAGAGAATCCCAGGACAGAAAGGTA...CAGA

   4750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   4625 TCTTCAGGGGGCTAGAAATCTGTTGCTATGGGCCCTTCACCAACATGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  74276 TCTTCAGGGGGCTAGAAATCTGTTGCTATGGGCCCTTCACCAACATGCCC

   4800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   4675 ACAG         ATCAACTGGAATGGATGGTACAGCTGTGTGGTGCTTC
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  74326 ACAGGTA...TAGATCAACTGGAATGGATGGTACAGCTGTGTGGTGCTTC

   4850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   4716 TGTGGTGAAGGAGCTTTCATCATTCACCCTTGGCACA         GGTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
  76235 TGTGGTGAAGGAGCTTTCATCATTCACCCTTGGCACAGTA...CAGGGTG

   4900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   4757 TCCACCCAATTGTGGTTGTGCAGCCAGATGCCTGGACAGAGGACAATGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  77693 TCCACCCAATTGTGGTTGTGCAGCCAGATGCCTGGACAGAGGACAATGGC

   4950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   4807 TTCCATG         CAATTGGGCAGATGTGTGAGGCACCTGTGGTGAC
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
  77743 TTCCATGGTA...CAGCAATTGGGCAGATGTGTGAGGCACCTGTGGTGAC

   5000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   4848 CCGAGAGTGGGTGTTGGACAGTGTAGCACTCTACCAGTGCCAGGAGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  79624 CCGAGAGTGGGTGTTGGACAGTGTAGCACTCTACCAGTGCCAGGAGCTGG

   5050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   4898 ACACCTACCTGATACCCCAGATCCCCCACAGCCACTACTGACTGCAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  79674 ACACCTACCTGATACCCCAGATCCCCCACAGCCACTACTGACTGCAGCCA

   5100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   4948 GCCACAGGTACA AGCCACAGGACCCCAAGAATGAGCTTACAAAGTGGCC
        ||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  79724 GCCACAGGTACAGAGCCACAGGACCCCAAGAATGAGCTTACAAAGTGGCC

   5150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   4997 TTTCCAGGCCCTGGGAGCTCCTCTCACTCTTCAGTCCTTCTACTGTCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  79774 TTTCCAGGCCCTGGGAGCTCCTCTCACTCTTCAGTCCTTCTACTGTCCTG

   5200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   5047 GCTACTAAATATTTTATGTACATCAGCCTGAAAAGGACTTCTGGCTATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  79824 GCTACTAAATATTTTATGTACATCAGCCTGAAAAGGACTTCTGGCTATGC

   5250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   5097 AAGGGTCCCTTAAAGATTTTCTGCTTGAAGTCTCCCTTGGAAATCTGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  79874 AAGGGTCCCTTAAAGATTTTCTGCTTGAAGTCTCCCTTGGAAATCTGCCA

   5300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   5147 TGAGCACAAAATTATGGTAATTTTTCACCTGAGAAGATTTTAAAACCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  79924 TGAGCACAAAATTATGGTAATTTTTCACCTGAGAAGATTTTAAAACCATT

   5350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   5197 TAAACGCCACCAATTGAGCAAGATGCTGATTCATTATTTATCAGCCCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  79974 TAAACGCCACCAATTGAGCAAGATGCTGATTCATTATTTATCAGCCCTAT

   5400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   5247 TCTTTCTATTCAGGCTGTTGTTGGCTTAGGGCTGGAAGCACAGAGTGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  80024 TCTTTCTATTCAGGCTGTTGTTGGCTTAGGGCTGGAAGCACAGAGTGGCT

   5450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   5297 TGGCCTCAAGAGAATAGCTGGTTTCCCTAAGTTTACTTCTCTAAAACCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  80074 TGGCCTCAAGAGAATAGCTGGTTTCCCTAAGTTTACTTCTCTAAAACCCT

   5500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   5347 GTGTTCACAAAGGCAGAGAGTCAGACCCTTCAATGGAAGGAGAGTGCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  80124 GTGTTCACAAAGGCAGAGAGTCAGACCCTTCAATGGAAGGAGAGTGCTTG

   5550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   5397 GGATCGATTATGTGACTTAAAGTCAGAATAGTCCTTGGGCAGTTCTCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  80174 GGATCGATTATGTGACTTAAAGTCAGAATAGTCCTTGGGCAGTTCTCAAA

   5600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   5447 TGTTGGAGTGGAACATTGGGGAGGAAATTCTGAGGCAGGTATTAGAAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  80224 TGTTGGAGTGGAACATTGGGGAGGAAATTCTGAGGCAGGTATTAGAAATG

   5650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   5497 AAAAGGAAACTTGAAACCTGGGCATGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  80274 AAAAGGAAACTTGAAACCTGGGCATGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGC

   5700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   5547 ACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATCACTGGAGGTCAGGAGTTCGAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  80324 ACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATCACTGGAGGTCAGGAGTTCGAAAC

   5750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   5597 CAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAGAAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  80374 CAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAGAAATT

   5800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   5647 AGCCGGTCATGGTGGTGGACACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGTGGCTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  80424 AGCCGGTCATGGTGGTGGACACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGTGGCTAA

   5850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   5697 GGCAGGAGAATCACTTCAGCCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  80474 GGCAGGAGAATCACTTCAGCCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGA

   5900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   5747 TCATACCACGGCACTCCAGCCTGGGTGACAGTGAGACTGTGGCTCAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  80524 TCATACCACGGCACTCCAGCCTGGGTGACAGTGAGACTGTGGCTCAAAAA

   5950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   5797 AAAAAAAAAAAAA GGAAAATGAAACTAGGAAAGGTTTCTTAAAGTCTGA
        |||||||||||||-||||||||||||||| | || ||||| |||||||||
  80574 AAAAAAAAAAAAAAGGAAAATGAAACTAGAAGAGATTTCTAAAAGTCTGA

   6000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   5846 GATATATTTGCTAGATTTCTAAAGAATGTGTTCTAAAACAGCAGAAGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  80624 GATATATTTGCTAGATTTCTAAAGAATGTGTTCTAAAACAGCAGAAGATT

   6050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   5896 TTCAAGAACCGGTTTCCAAAGACAGTCTTCTAATTCCTCATTAGTAATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  80674 TTCAAGAACCGGTTTCCAAAGACAGTCTTCTAATTCCTCATTAGTAATAA

   6100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   5946 GTAAAATGTTTATTGTTGTAGCTCTGGTATATAATCCATTCCTCTTAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  80724 GTAAAATGTTTATTGTTGTAGCTCTGGTATATAATCCATTCCTCTTAAAA

   6150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   5996 TATAAGACCTCTGGCATGAATATTTCATATCTATAAAATGACAGATCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  80774 TATAAGACCTCTGGCATGAATATTTCATATCTATAAAATGACAGATCCCA

   6200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   6046 CCAGGAAGGAAGCTGTTGCTTTCTTTGAGGTGATTTTTTTCCTTTGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  80824 CCAGGAAGGAAGCTGTTGCTTTCTTTGAGGTGATTTTTTTCCTTTGCTCC

   6250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   6096 CTGTTGCTGAAACCATACAGCTTCATAAATAATTTTGCTTGCTGAAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  80874 CTGTTGCTGAAACCATACAGCTTCATAAATAATTTTGCTTGCTGAAGGAA

   6300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   6146 GAAAAAGTGTTTTTCATAAACCCATTATCCAGGACTGTTTATAGCTGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  80924 GAAAAAGTGTTTTTCATAAACCCATTATCCAGGACTGTTTATAGCTGTTG

   6350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   6196 GAAGGACTAGGTCTTCCCTAGCCCCCCCAGTGTGCAAGGGCAGTGAAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  80974 GAAGGACTAGGTCTTCCCTAGCCCCCCCAGTGTGCAAGGGCAGTGAAGAC

   6400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   6246 TTGATTGTACAAAATACGTTTTGTAAATGTTGTGCTGTTAACACTGCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  81024 TTGATTGTACAAAATACGTTTTGTAAATGTTGTGCTGTTAACACTGCAAA

   6450     .    :    .
   6296 TAAACTTGGTAGCAAACA
        ||||||||||||||||||
  81074 TAAACTTGGTAGCAAACA

END